《誰是被害者》第二季劇情故事比較不像首季有牽涉較多社會議題的探討，而是聚焦在角色的人性，守護的私心，原本只是青少年離家，相互找到友誼的旅程，結果成了意外的殺人案件，引發後續的連鎖反應，如同林明誠的角色台詞，「一隻蝴蝶震動翅膀，最終可能導致一場暴風雨。那個晚上的最初，只是我想保護大家的心。」《誰是被害者2》蝴蝶效應般的意外命案，15年後引發了連環殺人案。
《誰是被害者2》在懸疑推理的故事線，佈在三個案件上，那誰是兇手，成了追劇的另個樂趣。以下愛德華《誰是被害者》第二季劇情心得有劇透，如未追劇，請自行斟酌閱讀。
《誰是被害者》第二季為未來前傳及後續故事鋪陳
《誰是被害者》第二季雖然整體評價比首季差了一些，但是劇組有企圖心打造出《誰是被害者》宇宙，從年輕演員的安排到角色的延伸，故事拉出更多未解懸案、檢調的問題，預留未來繼續拍攝的空間。
故事先從青年時的方毅任（曾敬驊飾）與恩師林景瑞（喜翔飾）相識的過程，然後回到現今，一宗已完結的15年前蕭家穎情殺命案，重啟調查。接著很快張孝全飾演的方毅任，被牽扯進蕭家穎母親蕭敏君身亡事件。曾敬驊飾演年輕的方毅任，未來有可能觸及更多前傳的故事？
接著這季故事的關係人一一登場，藤岡靛的飾演張耿浩的角色，一直刁難方毅任，故事線佈得很深，而且第二季結束，還未揭露他的目的。可想見到了第三季，他的背景故事才會開始。
蘇慧倫飾演法醫薛欣寧的角色，成了兇案劇情反轉的焦點
蘇慧倫飾演法醫薛欣寧的角色，看似協助方毅任，但秘密藏得很深。劉俊謙飾演林明誠，則是全劇最大的嫌疑人，過去的命案和現今蕭敏君連環殺人案也與他有關。
如果留意，袁綺翎死亡時，喉嚨器官遭完整切除，再到劉書妍眼睛遭切除，可見殺手的手段十分殘忍，同時劇中認定兇手是具有手術、醫學能力的人，那從已登場的幾位角色（如果後面幾集不會突然出現新的隱藏殺手），蘇慧倫飾演法醫薛欣寧的機率不小，只是她的犯案動機是什麼？還有和15年前的命案有何關係？
這也是《誰是被害者2》即使故佈疑陣，但卻有暗示薛欣寧一直要方毅任查真相的急切心理，讓觀眾懷疑她的身分，只是不解薛欣寧為何是兇手？
在半信半疑中，全劇最令人好奇的716公車的出遊事件，在5、6集就斷斷續續描述。直到最後一集，才告訴觀眾當時發生了什麼事？蕭家穎和陳央宇為何會死？薛欣寧和蕭家穎的關係，為何要接連殺害事件的關係人？
《誰是被害者2》更重要的推理安排，是想告訴你兇手背後的故事和犯案動機。
連環殺人事件的兇手不難猜是薛欣寧，只是她為何犯案？至於5年前，郭昕白事件則是殺人案件的鋪陳和蕭敏君復仇的開端，蕭敏君是從郭昕白的遺物了解女兒並非情殺，於是展開復仇計劃。
而全劇另個兇手是林明誠的父親，方毅任的恩師林景瑞，他為了保護兒子的犯行，湮滅證據，並殺害了郭昕白。
保護成了無情命案的原罪？
「守護」或者「保護」成了《誰是被害者2》這季劇情的重要命題。不管是父母對孩子的保護，工作上的相互掩護等，都是這季角色去思索和考驗的部分。
從716公車出遊事件，年少的林明誠偷偷帶出一把槍，他出自想保護一同出遊的逃家朋友，結果途中有人想返家，他一時激動拿槍喝止，陳央宇向前奪槍，槍火誤殺了陳央宇，隨後一群人急著離開、報案，蕭家穎先前與林明誠有著彼此守護的約定，蕭家穎拿槍威脅全體要繼續留下，結果在奪槍亂局中，被活活悶死。
林景瑞為了保護隱藏兒子的犯行，變動了犯案現場，做了破壞真相的結案，而方毅任當時因女兒曉孟受傷，相信恩師的審理調查而簽結，但更大的原因是，他不願掀開事件的真相，因為他怕失去這世上唯一懂他這個怪胎的恩師，於是守護著恩師的清譽。
當時事件留下來的人，為了守護自己未來的人生，決定共同隱藏了當時事件的真相。蕭敏君則是失去女兒，失去唯一守護的對象，而失心成了殺人如麻的黑寡婦。但如果追究到底，蕭敏君難到對女兒的死，沒有責任？
而張檢翻舊案，就是不滿警方包庇掩護林景瑞審理蕭家穎情殺命案的問題，守護和保護，究竟是犯罪的藉口，還是無法理解想守護對象需要的藉口？
《誰是被害者》第二季演員角色上，李沐飾演江曉孟的戲分有更多情感的空間，她成了首季「留下來的人」，無法適應父親方毅任過度保護的相處關係，她和父親需要彼此理解，找出可以相互關心的方式。
至於首季重要的角色，許瑋甯飾演的記者徐海茵，戲分減了不少，她和方毅任的感情算是點到，角色比較是功能性的幫助方毅任和曉孟。王識賢飾演的趙承寬一樣少了許多，偏向辦案的工具角色。
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