《不可能的任務：致命清算第一章》沒有片尾彩蛋，但結局未完，故事續留至《不可能的任務：致命清算第二章》，只是這集電影仍有完整的情節，即觸動「生存體」AI人工智慧的「鑰匙」已經確定。而「IMF」小隊之後又該如何面對這個看不見的敵人，伊森韓特又該如何進行下一步，至於重要角色領便當，還有機會反轉？接著愛德華下面的結局解析有劇透，如未觀影，請自行斟酌閱讀。
蕾貝卡弗格森飾演的伊爾莎死了嗎？
《不可能的任務：致命清算第一章》最刺激的動作劇情，包括羅馬飛車追逐、威尼斯巷戰打鬥及結局的飛車跳崖、奧地利火車打鬥、斷橋火車出軌的驚險逃命。
其中從派對出來的威尼斯巷戰，《不可能的任務：失控國度》、《不可能的任務：全面瓦解》這兩集，重要的軍情六處女特務，由蕾貝卡弗格森飾演的伊爾莎，竟然在橋上與反派蓋布瑞（伊沙摩路斯飾）打鬥，被殺害了。
伊爾莎的死，對伊森韓特（湯姆克魯斯飾）應該有不少打擊，畢竟他是韓特喪妻之後，重要的一段感情之一，愛德華覺得伊爾莎領便當的處理，是有點意外，未來這角色有機會回歸？
目前從第二章的演員名單，仍看到蕾貝卡弗格森的名字，未來會以回憶的方式回歸？還是只是詐死？（希望是詐死，愛德華還蠻喜歡這角色）
海莉艾特沃飾演神偷葛莉絲
這集的女主角可以說是海莉艾特沃飾演神偷葛莉絲，伊爾莎的角色戲份減少外，連同氣場極大的「白寡婦」艾蘭娜（凡妮莎寇比飾）也減少了許多。
海莉艾特沃先前在大銀幕最令觀眾深刻的角色即漫威美國隊長的摯愛佩姬卡特，而拍攝《不可能的任務：致命清算第一章》與阿湯哥傳出緋聞，不過電影拍攝結束，她真正定情一名音樂人。
葛莉絲這個角色是白寡婦請來偷取十字鑰匙，在伊爾莎死後，不得不做出與「IMF」小隊合作的選擇，在結局奧地利火車打鬥、斷橋火車出軌等橋段，她成了小隊必須竊取「鑰匙」的關鍵，易容成「白寡婦」與前情報局局長基崔吉談判交易。
結局由於飛行傘只有一具，伊森韓特逃出，而她如「IMF」小隊兵推時，與基崔吉談條件，由基崔吉暫時「保護」，至於第二章，伊森韓特會在信守承諾，救她出來。
龐克萊門捷夫飾演反轉角色派瑞絲
「螳螂女」龐克萊門捷夫在《不可能的任務：致命清算第一章》有不一樣的反派殺手演出，她在最後被大反派蓋布瑞認為背叛（原因是伊森韓特未殺她，令蓋布瑞起疑心），刺她一刀，而在結局結尾，她受重傷伸手拉了伊森韓特報恩，並說出了「鑰匙」的作用，即電影開場的潛水艇事件，「鑰匙」可控制「生存體」AI人工智慧。
看似她斷氣，不過在後來的情報局探員趕來，發現她仍一息尚存。派瑞絲的角色在第二章仍存在，未來她也會加入「IMF」小隊？
蓋布瑞是主要反派，但真正的敵人是AI
《不可能的任務：致命清算第一章》的故事，算是鋪陳AI人工智慧在潛水艇事件反叛，「生存體」即將控制世界的恐怖未來，而伊森韓特和小隊就要阻止這個恐怖的威脅發生，但麻煩的是「生存體」極快的發展，又有恐怖分子蓋布瑞想要奪取。
這集的劇情算是交待伊森韓特和小隊想解開「十字鑰匙」的謎，結果遇到蓋布瑞和各家殺手的爭奪，未來第二章對決AI人工智慧的主線劇情才會上演。
結局在火車上的安排，致敬首集的彩蛋
1996年《不可能的任務》開啟了這系列，劇情的角色也經歷了近30年，首集結尾即在火車上發生，《不可能的任務：致命清算 第一章》第三幕開始的結局安排在火車上進行，多少有致敬的味道。
班吉（賽門佩吉飾）在最後無厘頭的引導伊森跳上火車，成了全片動作戲最高潮，即阿湯哥從懸崖飛車的驚人一跳。
