《蟻人與黃蜂女》與過去漫威電影宇宙的獨立電影相較，它的敘事格局不大，甚至很小，劇中甚至沒有真正代表性的反派，故事主題，劇情延續著上集《蟻人》發生的事件，第一代黃蜂女珍妮特受困在量子領域，似乎已犧牲無法回到現實世界，但漢克皮姆見到史考特居然能縮成亞原子，克服蟻人裝的調節器，從量子領域再回到現實世界，令他與女兒興起救回愛妻的信心。
而《蟻人與黃蜂女》即《蟻人2》的故事，就是從解決漢克皮姆一家的私事出發，只是未來放到漫威電影宇宙的整體情節中，交待這一段營救第一代黃蜂女的故事，就有機會成了《復仇者聯盟3》最後一半超級英雄及宇宙生物，被薩諾斯彈指灰飛煙滅，受困在量子領域中的解套方法。
不過《蟻人與黃蜂女》不會把這些未來該如何解救超級英雄們的故事說透，因為故事的發生時前是在《美國隊長3》之後的兩年及《復仇者聯盟3：無限之戰》之前的一小段時間；真正的答案，漫威當然會留在《復仇者聯盟4》來說，《蟻人與黃蜂女》還是聚焦在自己蟻人一族的角色上。在閱讀愛德華以下的影評及劇情分析前，建議可先參考：關於《蟻人與黃蜂女》，你會想了解的5件事！一文，了解故事角色的相關背景，更能理解續集故事為何會如此延續的原因。
漢克皮姆（麥克道格拉斯飾演）算是很獨立自主的超級英雄，他和愛妻黃蜂女珍妮特（蜜雪兒菲佛飾演）早在「鋼鐵人」父親霍華史塔克創辦神盾局的年代，就默默做正義的英雄事，在一次為了阻止蘇聯核彈引爆，炸毀世界的事件中，黃蜂女珍妮特犧牲了自己，掉入量子領域，從此，漢克皮姆個性更為孤立，與女兒荷普（伊凡潔琳莉莉飾演）的關係也出現裂痕，因女兒無法原諒父親，為何母親消失，無法回家。（電影一開場，即在敘述幼年荷普痛失母親的心情）
從上集《蟻人》故事的一開始，可知為何漢克皮姆不爽史塔克家族，甚至過節甚深。當時1989年，漢克皮姆是神盾局的科學顧問，研究出可縮小至原子的「皮姆粒子」技術，但那時神盾局的創辦人霍華史塔克及高層隱瞞他偷偷生產皮姆粒子，令他感到不被尊重，也被侵犯，於是辭職捍衛自己的研究成果。
後來，神盾局被九頭蛇黑化，加上「復仇者聯盟」當家的仍是史塔克家族的東尼史塔克，漢克皮姆根本不想理會這個與他無關的「復仇者聯盟」超級英雄組織。（這些都是漢克皮姆心裡不想讓「蟻人」史考特參與內戰，黃蜂女未現身內戰的原因，而後史考特會後悔自己當時參與內戰，選擇在家接受拘禁的背景。）
第二代蟻人史考特（保羅路德飾演），未經漢克皮姆允許，就加入美國隊長陣營，參加了「復仇者聯盟」的內戰，到德國打了機場大戰而被捕，令他和女兒荷普不太滿史考特的私自決定。要知道，漢克皮姆是自我成一家的超級英雄主義者，他相當有才，但性格高傲，這集過去曾是他的助手比爾（勞倫斯費許朋飾演）就形容他獨斷、剛復，難以溝通的個性，也因此種下「幽靈」艾娃（漢娜約翰卡門飾演）一家的不幸。
當史考特被FBI拘禁在家，因先前到過量子領域，意外與珍妮特有了意識的連結，而珍妮特像附身般，藉由史考特的軀體，向漢克皮姆傳達自己受困的訊息。之後荷普找上了史考特，而漢克皮姆為了取得打造進入量子領域的墜道零組件，與科技黑市交易，沒料到黑市商人（華頓哥金斯飾演）一幫人沒信用，也讓第二代黃蜂女荷普秀上全新黃蜂裝，打擊這些壞蛋惡劣的行徑。
只是在這次行動中，意外「幽靈」艾娃現身，而後艾娃與漢克皮姆等三人，展開爭奪與保護量子實驗室的對決。
在爭搶過程中，過去竊盜團隊的路易（麥可潘納飾演）一行人，這集他們合作開了保全公司，而他們這組團隊，也是故事的潤滑劑，不過這集的設計，就顯得比較刻意一些。像注入一針真心話血清，讓路易再發揮他話多到說不完的拉D賽、瞎攪和功力。
而為何「幽靈」艾娃急著要搶奪量子實驗室？因為幼年的爆炸事件，她的身體粒子被破壞，雖有了可穿透牆面，甚至隱形的超能力，但被神盾局利用成殺人工具，內心痛苦外，也飽受身體分解的痛苦，當知道自己可能因量子領域珍妮特釋出的身體粒子，而得到修補，於是竭盡所能想搶到量子實驗室，否則她的性命也將要終結。
只是艾娃如果吸收了珍妮特的身體粒子，珍妮特也就無法得救，所以兩方不停的角力。最後，當漢克皮姆將珍妮特從量子領域救回現實世界，漫威劇情給了很溫馨的結局，就是兩方都沒有人因此受害。畢竟艾娃的恨也不是有意，珍妮特牽起艾娃的手，給予關懷和部分修復力，象徵著一種兩代和解，也為丈夫當年的決定，造成艾娃一家的不幸致意。
這也是為何之後漢克皮姆一家（史考特算是女婿了）會再想盡辦法治療艾娃，為她修復身上的缺補的粒子。感覺《蟻人與黃蜂女》的結尾，老是慢半拍的FBI特工吳（藍道爾朴飾演，這集的甘草人物）追捕蟻人，艾娃與養父比爾離開，預留些伏筆，是否會成為未來如有《蟻人3》再延伸的故事？
另外，漢克皮姆打造完量子墜道，根本不知甚至不管外在發生的大事，所以救回黃蜂女珍妮特，如放在漫威電影宇宙中，算是未來能救回超級英雄們的插曲。《蟻人與黃蜂女》片尾兩彩蛋，技巧連結上《復仇者聯盟3》薩諾斯彈指消滅一半人口的發生時間，想知道詳盡的片尾彩蛋分析，可閱讀：
