《與神同行：最終審判》與首集故事相比，劇情的演進比較分散，主要拆成陰間和陽間兩條線的敘事發展，而首集是罪與罰，審判的主角只有貴人金自鴻一人，續集雖然延伸首集結尾第49個貴人，接續審判金自鴻的弟弟金秀鴻，但最後所有的故事線，都會聚集在陰間三使者隊長江林公子的身上，等於續集故事重點即落在解陰間三使者的千年前世之謎。過去，千年的前世祕密是因，之後，成了江林要做陰間使者贖罪的果，續集可看作是江林公子的千年之悔。
由於陰間三使者的因緣相生，在觀看《與神同行：最終審判》前，應對首集內容及人物組合有了解。另外，愛德華寫的這篇關於《與神同行：最終審判》，你會想了解的5件事！可以參考閱讀，相信對進入劇情的理解有所幫助。接下來的影評分析，如未觀影，請自行斟酌閱讀。
《與神同行：最終審判》的故事隱藏的千年的祕密驚人，江林（河正宇飾演）過去極為黑暗，所做的一切，已是滅親的大罪。而陰間的日值使者解怨脈（朱智勛飾演）及月值使者李德春（金香起飾演）千年前在人世的死因，記憶被閻羅大王刪除隱瞞著，直到成造神（馬東石飾演）告訴他們，自己是千年前帶領他們至陰間的使者，才解開身世的謎底。
江林的罪行算是壞人吧？《與神同行》連兩集，都強調「原諒」與「寬恕」，成造神認為，「世上並沒有壞人，只有最壞的情況。」而慈悲是化解恨的動力，放下這些憤怒，才有助於未來。而會講述這段過去，成造神的用意是希望解怨脈與李德春，用慈悲寬懷的角度，看陽間許春三與許賢東爺孫倆的處境，再寬限許春三的壽命。
只是陽間成造神在說這些過去的故事時，並非一次性講完，電影採交插敘述的手法，因為陰間上演審判金秀鴻（金東旭飾演）的故事未完。他以為自己的死因，就是真相嗎？原來關懷兵元東延及朴武信中尉活埋他時，仍知他存活，只是為了逃避責任，結果加深了罪孽。
而元東延及朴武信中尉當時的處境，如前面成造神所言，是在「最壞的情況」出此選擇，這選擇其實也如同江林最後在戰場上，拋棄仍有喘息的父親，做下的狠心抉擇。
這樣的犯行，難道不用付出代價嗎？江林以自己藏在內心的千年歉意，久久成了纏繞在他記憶中，成了無法抹去的折磨，他的良心即使已發現，但當事人已不在，沒機會再向父親說道歉（當然江林為他的罪行付出千年在陰間當使者的代價，這個解釋即是片尾第二個彩蛋的解謎）。
而最後的一段審問，劇情設計即是為了塑造江林一角的心底想法，同時做出對應金秀鴻處境的安排，藉由朴中尉夢境對金秀鴻的道歉，讓他有機會在世上，向死者承認過錯，得到原諒。在現實中，朴中尉入監服刑，這是他得為自己的犯行，付出司法的代價。
承認自己的過錯，跟對方說個道歉很難嗎？是的，並不容易，對江林來說是如此。江林前世的成長背景，造成他自己的困境，而後在陰間千年使者，身為隊長的他，團隊要一起合作，協助49個貴人投胎轉世的任務，萬一解怨脈和李德春知道真相，會原諒他嗎？如果無法原諒，那不合作的團隊，任務能執行完畢嗎？如果影響他們千年之後無法轉世，那又會是什麼情況？這些或許是江林始終不敢開口向他們說道歉的原因。
但所有的局，有因就有果，甚至有著因與緣般的「會者定離，去者必返」道理。意思即相聚的人總有離別的時候，離開的人總有歸來的時刻。而有前「因」，似乎就有「緣」的相遇來解「因」。陰間三使者的組合是閻羅大王（李政宰飾演）安排的，但隱藏的祕密，終究無法遮蓋，解怨脈、李德春，千年之後遇到千年之前的陰間使者成造神，解開謎團。
江林的淚為何而流？他是嘆息自己的不甘心？還是感嘆自己在世無法對父親說道歉？在陰間千年，他懷著苟且不敢告訴解怨脈與李德春真相，背負千年的惡行，受著記憶折磨。最後的一場審判，除了藉此告訴朴中尉，道歉需要即時和勇氣，也另有意，向一旁偷聽的解怨脈與李德春，表明自己的愧疚，和千年以來贖罪的心聲。而相對的，原諒也不容易，解怨脈與李德春先行原諒彼此，再寬恕了江林，繼續在陰間一起做為團隊為貴人辯護。
《與神同行：最終審判》這集比較特別的特效是重現侏羅紀世界的迅猛龍、暴龍、滄龍，雖然這些是因金秀鴻所懼怕的事物而生，但其實跟劇情沒有太多相關，據說導演金容華自己的創作，深受詹姆斯卡麥隆及史蒂芬史匹柏影響，這一段的安排有致敬的意味。
另外，《與神同行：最終審判》陽間成造神與許氏爺孫的故事，牽扯了都更及暴力討債，更拉到了經濟變動與投資理財的生活話題，這一部分反應了部分韓國社會的弱勢問題（其實亞洲各國一樣有此問題），只能說家神還真是守護人類的神，當前的時勢都要跟風一下。不過電影的結局原本投資損失的部分，都上漲回來了，也給爺孫經濟上有了幫助。不過這段故事，算是支線，只是輔助成造神在解答日、月值使者兩人對千年之謎的疑問。
德春父母的死、白狼解怨脈的死、密言江林的死、德春的死，甚至江林父親江文植在戰場被而兒子棄之而死，這些因，環環相扣，最後形成果，也有了善念的一面來圓融。但《與神同行：最終審判》正片結局的結束，還並未完全解答完畢，因為片尾彩蛋，特別第二個，閻羅大王的解密，有如一記回馬槍的轉折，加重這故事真正的因果關係。如對片尾彩蛋，想要有更多的了解，可閱讀：從《與神同行2》片尾兩彩蛋，看角色關係變化及故事未來發展！
