《移動迷宮：焦土試煉》（Maze Runner: The Scorch Trials）做為《移動迷宮》的續作，部分謎也逐漸在這集解開。這集解開了湯瑪士自己的疑惑和身世，電影一開始就演出他過去的片斷記憶，小時候，他被迫與母親分離，被佩琪博士帶走做實驗。做什麼實驗？電影用倒敘、插敘的手法，讓觀眾隨著主角一步一步進入他的過去和故事的劇情。
主角湯瑪士（狄倫歐布萊恩飾演）一行人從迷宮逃出後，被接送到一個神祕的庇護機構，但事情並不單純。機構負責人詹森問湯瑪士，「你站在哪一邊？」湯瑪土沒有回答詹森想要的答案，他回答自己和幽地鬥士們一起。
湯瑪士還未完全清楚自己的過去和為何被送入迷宮中，但他真情善念與重視朋友患難相處的性情一直未變，這個性也是未來他與整個WICKED組織理念不合的主因。（WICKED全名為World In Catastrophe Killzone Experiment Department，意即「災難世界：殺戮地帶實驗部」）
湯瑪士從不了解自己的過去，到記憶拚湊出自己原來也曾是WICKED的一員，而詹森即希望湯瑪士能站在WICKED這一邊。
為何要選邊站？《移動迷宮：焦土試煉》電影一直到最後30分鐘，與WICKED相對的反叛軍「右支」出現，整個移動迷宮的故事核心及湯瑪士的過去連結，一一解開。在山區，幽地鬥士們終於找到了真正的庇護「右支」，「右支」的瑪莉博士認識他，告訴他的過往。
原來世界受到太陽閃焰的侵襲，人們會得到一種「閃焰症」，「閃焰症」像是病毒般，會使人變成「狂客」（有點像活死人、死屍），而年輕的孩子對閃焰症免疫，於是WICKED組織強迫抓這些免疫的孩子做實驗，想要找出解藥，但使用的手段相當殘酷。
為了人類活命的解藥，年輕世代的生命就該被犧牲？
湯瑪士原本在WICKED負責實驗研發血清，不願看到自己的同伴被送進迷宮、成為血清的實驗品而死去，於是有了反抗心，結果最後被送進迷宮。在被送住迷宮前，他給了瑪莉博士所有WICKED實驗室的位置，這是「右支」可以攻擊WICKED，營救孩子的重要消息來源。也就是說，沒有湯瑪士，「右支」無法成事。
瑪莉博士告訴湯瑪士自己也曾是WICKED的一員，「一開始WICKED一心想救人，找到治療方法，拯救世界。你們這些孩子顯然是解答，因為你們免疫，可是為什麼？我們後來找到答案，免疫者的腦部會製造一種酵素，一旦血液分離，就能充當有效的製劑，阻止病毒擴散，但這種酵素無法生產，只能從免疫者身上擷取。」所以為加速取得酵素，WICKED不擇手段，強迫從這群年輕人的生命和血液，提煉血清。
「如果WICKED得逞，他們就會犧牲掉一整個世代。」瑪莉這句話，也是整個故事的衝突核心，但WICKED組織的佩琪博士卻認為年輕世代犧牲有價值，她認為找到治療方法，是達到成果的一個手段 。認同佩琪博士這樣的理念，也有不少人，而湯瑪士所摯愛的泰瑞莎（凱亞絲柯黛蘭莉歐飾演）即是。
泰瑞莎小時候，看到母親被「閃焰症」折磨到挖去雙眼，不成人形，一直盼望WICKED能做出解藥，解救其他受苦的人，她告訴湯瑪士，「有無數跟我一樣悲慘的故事，我們不能放棄他們於不顧。」所以泰瑞莎成了WICKED在幽地鬥士的臥底，通報WICKED，毀了山區「右支」。
湯瑪士會有另一個愛情選擇嗎？
這集另一個女角布蘭妲（羅莎薩拉查飾演），看得出她對湯瑪士有好感，在落難奔逃時，他們兩人互助，在酒吧一段，雖有迷幻酒精潻加，但布蘭妲對湯瑪士有顯愛意。
後來，布蘭妲被狂客抓傷，在「右支」，也是湯瑪士的血清救了她。最後一集《移動迷宮：死亡解藥》或許也會有新的安排。
《移動迷宮：焦土試煉》這集的視覺效果，主要是沙漠般的焦土、廢棄的大樓取代上集的迷宮，而上集恐怖的怪物鬼火獸，則由狂客取代，只要狂客一出現，驚恐、奔逃就出現。這集加入了不少新角色串場讓劇情推動，原先幽地鬥士一員紐特（湯瑪士桑格斯特飾演）戲分就少了些。
湯瑪士對朋友是有情有義的，這也是《移動迷宮》要傳達珍視友情的善念，當民豪（李基弘飾演）被WICKED抓走，湯瑪士不願自己安危，選擇回WICKED基地救民豪，這是「天方夜譚」，但湯瑪士堅持要做，他有什麼計劃，如何打倒WICKED，續集《移動迷宮：死亡解藥》，將給解答。（《移動迷宮：死亡解藥》原定於2017年2月17日在美國上映，但因狄倫歐布萊恩在拍片中受傷，上映日期延至2018年1月12日。）
